1、光能自養型。屬于這一類的微生物都含有光合色素，能以光作為能源，二氧化碳作為碳源。如藍細菌含葉綠素、紅硫細菌和綠硫細菌等少數微生物含細菌葉綠素能利用光能從二氧化碳合成細胞所需的有機物質。但這種細菌在進行光合作用時，除了需要光能外還需有硫化氫的存在，它們從硫化氫中獲得氫，而高等植物則是在水的光解中獲得氫以還原二氧化碳。2、光能異養型。以二氧化碳為主要碳源或唯一碳源，以有機物如異丙醇作為供氫體，利用光能將二氧化碳還原成細胞物質，紅螺菌屬中的一些細菌屬于此種營養類型。3、化能自養型。以二氧化碳或碳酸鹽作為唯一或主要碳源，以無機物氧化釋放的化學能為能源，利用電子供體如氫氣、硫化氫、二價鐵離子或亞硝酸鹽等使二氧化碳還原成細胞物質。4、化能異養型。